Pro využívání e-zdrojů prostřednictvím Shibbolethu není nutné provádět žádná speciální nastavení, ovšem přes tuto technologii nejsou zatím dostupné všechny databáze. U e-zdrojů, které podporují Shibboleth je v seznamu databází uveden odkaz "přihlášení shibboleth", který vede přímo na přihlašovací stránku. Uživatelé se autentizují zadáním svého CRO jména a hesla. Pokud jsou tyto údaje platné, je uživatel připojen na daný zdroj, se kterým může okamžitě pracovat. Ne vždy je využití přímých odkazů možné, např. pokud se přihlašujete přímo ze stránek zdroje. V takovém případě je potřeba se před přihlášením blíže identifikovat.