RNDr. Jiří Martinů, Ph.D., disertační práce Výzkum inteligentních metod zpracování medicínských obrazů, včetně možnosti využití FPGA platformy; obhájena 20. 2. 2024

Mgr. Jan Drastik, Ph.D., disertační práce Robustní výpočty v morfogenetických systémech a jejich vizualizace; obhájena 8. 2. 2023

Mgr. Daniel Valenta, Ph.D., disertační práce Smečkové algoritmy a membránové multiagentní systémy; obhájena 20. 12. 2021

Mgr. Vladimír Smolka, Ph.D., disertační práce Bakteriální multiagentní systémy; obhájena 31. 5. 2021

PaedDr. Michal Rojček, Ph.D., disertační práce Spracovanie informačných zdrojov pomocou ART sietí; obhájena 19. 12. 2018

Mgr. David Beneš, Ph.D., disertační práce Multiagent models in molecular and cellular biology; obhájena 22. 9. 2017

Ing. Jiří Blahuta, Ph.D., disertační práce Autonomní rozhodovací systém pro diagnózu Parkinsonovy choroby; obhájena 15. 9. 2015

Ing. Marek Horváth, Ph.D., disertační práce Aplikácia objavovania poznatkov v databázach pre prediktívne modelovanie; obhájena 19. 9. 2013

RNDr. Milan Jakel, Ph.D., disertační práce Autonomní systémy pro analýzu finančních trhů; obhájena 12. 2. 2013

RNDr. Miroslav Langer, Ph.D., disertační práce Agenti v prostředí ekogramatických systémů; obhájena 17. 9. 2012

RNDr. Lucie Ciencialová, Ph.D., disertační práce P kolonie; obhájena 25. 4. 2008

RNDr. Šárka Vavrečková, Ph.D., disertační práce Kolonie a možné vlivy prostředí; obhájena 25. 4. 2008